Kondado ang Juneau County sa Tinipong Bansa. Nahimutang ni sa estado sa Wisconsin, sa sidlakang bahin sa nasod, 1,200 km sa kasadpan sa Washington, D.C. Adunay 26,664 ka molupyo. Naglangkob kin og 2,083 ka kilometro kwadrado. Juneau County mopakigbahin sa usa ka utlanan sa Wood County, Adams County, Columbia County, Sauk County, Vernon County, Monroe County, ug Jackson County ang ulohan sa nasod.